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菌根共生网络嵌套性判定的零模型选择

论文摘要

零模型是判定网络嵌套性的重要依据,菌根共生关系网络经常出现高度非对称性,该文通过探究矩阵非对称变化对基于不同零模型构建方法的网络嵌套性的影响,试图为非对称网络零模型的选择提供依据。结果表明:不同零模型保守性不同,增加限定条件减少零模型构建过程中的自由空间,高度限定条件易导致第II类错误。高度非对称网络会增加基于完全随机（r00）零模型的矩阵温度（NT）偏离、降低配对重叠度（NODF）偏离,标准化指数z-score值显示网络非对称增加后有助于NT和NODF显著性判定。行或列限定对非对称网络嵌套性判定的影响存在差异,列限定（c0）的网络嵌套性判定对网络非对称性变化的响应规律与r00零模型的响应趋势基本一致,具有更低的嵌套性偏离和标准差值。行限定（r0,包括行列限定（backtrack））零模型NT值和NT偏移随矩阵非对称性的变化保持稳定,较之c0零模型在高度非对称网络中呈现更低的NODF偏离值。选用完全随机和限定零模型相结合的方法,有助于更加准确判断非对称网络是否具有嵌套结构。高度非对称网络嵌套性判定中对行属性特征比较敏感,不同非对称性网络间嵌套性水平相比较时选用r0零模型要优于r00和c0零模型。

论文目录

  • 1 研究方法
  •   1.1 关系矩阵的构建
  •   1.2 嵌套性指标选择
  • 2 结果
  •   2.1 不同零模型嵌套性度量值变化特征
  •   2.2 矩阵行列属性对完全随机矩阵嵌套值的影响
  •   2.3 非对称性对不同零模型矩阵温度的影响
  •   2.4 非对称性对不同零模型配对重叠度的影响
  • 3 讨论
  •   3.1 不同零模型在嵌套性判定中保守性的差异
  •   3.2 非对称网络与传统近方形网络在嵌套性判定中的不同
  •   3.3 单网络嵌套性的判定及多网络间的比较
  • 4 结论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 林力涛,马克明

    关键词: 关系网络,嵌套性,零模型,网络非对称性

    来源: 植物生态学报 2019年07期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 数学,生物学

    单位: 中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室,中国科学院大学

    基金: 国家自然科学基金(31470481)~~

    分类号: Q143.2;O157.5

    页码: 611-623

    总页数: 13

    文件大小: 1214K

    下载量: 138

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/e5592f2eb7d6b7a6f4faed91.html