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蝎蝽次目线粒体基因组22个tRNA基因的比较研究(半翅目:异翅亚目)

论文摘要

[目的]本研究旨在对蝎蝽次目11科线粒体基因组中22个tRNA基因的序列特征、遗传距离、同源基因相同核苷酸百分比和二级结构进行比较研究,同时基于22个tRNA序列构建蝎蝽次目的系统发育树。[方法]通过GenBank获得蝎蝽次目所有12个代表种的tRNA序列,在MEGA 6.0中计算tRNA基因序列特征和遗传距离,同源基因相同核苷酸百分比在BioEdit 7.1中进行,tRNA二级结构在RNA structure 5.8中构建。在RAxML 8.2.8和Mrbayes 3.2.5中构建系统发育树。[结果]结果显示蝎蝽次目11科核苷酸碱基组成（A+T）%平均含量为76.41%,碱基A和T的含量均高于G和C,其中多数种呈现A高于T,所有种呈现G高于C。蝎蝽次目11科间的遗传距离在0.13～0.26之间。核苷酸保守性较高的tRNA-L2、tRNA-T和tRNA-M基因均位于线粒体基因组的J链,核苷酸保守性较低的tRNA-V和tRNA-F基因均位于线粒体基因组的N链。蝎蝽次目11科内tRNA二级结构中氨基酸接受茎表现为较高的保守性,而环中除了反密码子环相对保守外,其余环都有不同程度的碱基变异。系统发育结果显示固蝽总科、仰泳蝽总科和划蝽总科均为单系,其中固蝽总科和仰泳蝽总科为姐妹群关系,其余总科的单系性没有得到很好的解析,可能与tRNA基因序列能够提供的有效系统发育信号较少有关。[结论]本研究补充了tRNA在蝎蝽次目研究中的不足,揭示了tRNA基因及其二级结构在比较线粒体基因组学研究中的重要性。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 分析方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 tRNA基因序列特征及遗传距离分析
  •   2.2 tRNA同源基因相同核苷酸百分比 （%INUC, Percent of identical nucleotides）
  •   2.3 系统发育分析
  • 3 讨论与结论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张丹丽,张苗苗,田菁,李悦锐,张虎芳

    关键词: 蝎蝽次目,线粒体基因组,比较研究,系统发育

    来源: 山西农业大学学报(自然科学版) 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 太原师范学院生物系,忻州师范学院生物系

    基金: 山西省来晋博士奖励科研启动基金(I170258),太原师范学院博士科研启动基金(I170174)

    分类号: Q963

    DOI: 10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201808009

    页码: 27-34

    总页数: 8

    文件大小: 473K

    下载量: 244

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/f0493ecb7fa45b7e16508d9a.html